菌落的裂解及DNA结合于纤维素滤膜
(1) 在一张保鲜膜上制作一个装有0.5mol/L NaOH的小洼(0.75ml),使菌落面朝上,将滤膜放到小洼上,展平保鲜膜,使滤膜均匀湿润,让滤膜留于原处2-3分钟。
(2) 用干纸巾从滤膜的下方吸干滤膜,用一张新的保鲜膜和新配制的0.5mol/L NaOH重复步骤(1)。
(3) 吸干滤膜,将滤膜转移到新的带有1mol/L Tris·Cl(pH7.4)的保鲜膜洼上。5分钟后吸干滤膜,再重复一次该步骤。
(4) 吸干滤膜,把它转移到有1.5mol/L NaCl、0.5mol/L Tris·Cl (pH7.4)的保鲜膜小洼上5分钟后吸干滤膜,转移到一张干的滤纸上,置于室温20-30分钟,使滤膜干燥。
(5) 将滤膜夹在两张干的滤纸之间,在真空烤箱中于80℃干烤2小时,固定DNA。
(6) 将固定在膜上的DNA与32 P标记的RNA进行杂交。
①细胞特异性mRNA转录的定位,可用于基因图谱,基因表达和基因组进化的研究;②组织中病毒DNA/RNA的检测和定位,如EB病毒mRNA、人类状瘤病毒和巨细胞病毒DNA的检测;③癌基因、抑癌基因及各种功能基因在转录水平的表达及其变化的检测;④基因在染色体上的定位;⑤检测染色体的变化,如染色体数量异常和染色体易位等;⑥分裂间期细胞遗传学的研究,如遗传病的产前诊断和某些遗传病基因携带者的确定,某些的诊断和生物学剂量测定等。同一样本可以多次做原位杂交实验吗?
一般情况下,如果操作没有得到理想的结果,是可以将探针洗涤然后进行再次的杂交的。如果使用的是直标型探针,还可以使用不同探针对同一样本进行反复杂交。针对不同的样本,处理方法略有不同。
原位杂交实操中哪些因素比较重要?
重要的因素:温度、光照、湿度和试剂的PH值。温度和湿度直接影响着探针和目标DNA的杂交效率;光照影响着荧光染料的强度,所以探针要避光保存,其已经杂交的片子可用防荧光淬火剂封片且避光保存;各种试剂pH也要达到要求,这也直接关系到原位杂交的稳定性。
荧光原位杂交(FISH)技术具有以下优点:
高特异性:荧光探针的合成是定向的,保证了杂交过程的特异性,可以有效地降低非特异性杂交和背景干扰。
高灵敏度:荧光信号的检测比性信号的检测更灵敏,可以检测出低拷贝数的DNA序列,甚至可以检测单个基因序列。
快速简便:FISH技术操作简便,杂交过程可以在数小时或数天内完成,而且不需要过于复杂的设备,便于在实验室开展。