苦草的雄花只有1枚发育的雄蕊，这是它与国内其他苦草属的区别要点之一。3枚花被展开，向后反卷，漂浮在水面，把雄蕊托起。苦草的花药已经退化，没有花药壁，白色的花粉直接长在花丝顶端。 雄花们浮在水面后，排成线状，或者分枝的枝状，如同是一个典雅的仪式，列好了队，准备去寻找它们的爱人。在有风吹过的时候，雄花群扫过水面，大大增加了跟雌花相遇的机会。当有一朵雄花接触到了雌花，其他雄花也会跟着围过来。雄花花粉的高度与雌花柱头的高度刚好一致，至于花粉来自哪一朵雄花已经没那重要了。
沉水草本。须根多数。茎极短缩。叶基生，绿色，有时基部带紫红色，条形，长10-20 (40) 厘米，宽4-7毫米，先端渐尖，边缘有细锯齿；叶脉7-9条，中脉明显。佛焰苞梗扁平，纤细，长2-12厘米；苞鞘长管状，扁平，绿色，先端2裂，长2-5厘米，宽约0.2厘米；花；萼片3，线形，绿色，长约6毫米，宽约1毫米；花瓣3，白色，长条形，长10-14毫米，宽0.5-0.8毫米；雄蕊3枚，长4-6毫米；
通过比较不同光照强度下苦草的生长情况，研究表明，苦草在光照较强的45%日光下为抑制作用，光照弱的2.5%日光下为促进作用，在光强10%日光下没有明显作用。
对苦草幼苗做了低光适应能力试验，也同样发现苦草幼苗有一定的低光适应能力，光强范围大约是7.1%~43.3%，为在浑浊水体中恢复、重建苦草种群提供了一定的实验依据。