由于乳酸菌本身的宿主特异性、抗逆性差、不容易存活等生理特性，使其很难起到理想的效果，极大的降低了其使用价值。
当乳酸菌进入胃液中时，由于胃液的pH较低，远低于乳酸菌的耐受阈值，导致大部分的乳酸菌都被胃液杀，只有少部分的乳酸菌能够进入肠道。为了克服以上问题，提高乳酸菌的使用效率和效果，通常采用包衣的技术来处理乳酸菌，提高其存活率，降低外界的干扰，使其能够到达肠道，更好地发挥调节肠道微生态平衡的功能。
益生元的乳酸菌微囊制备方法，该微囊以乳酸菌和益生元的混合物为芯材，以海藻酸钠和果胶为壁材，使微囊可以耐受胃酸并且保护芯材不受损害，从而在肠道能够更好的定植。三联益生菌微囊，该微囊由益生菌和两层保护层组成，其中保护层为海藻多糖，第保护层为壳聚糖，通过双层保护能够使益生菌更好的存活并发挥有益作用。
包膜益生菌的制备工艺，包括以下步骤：
S1.将活化的益生菌进行培养获得菌悬液，将芯材和菌悬液以1:2～1:3(w/v)的比例混合，获得菌乳液；
S2.称取膳食纤维、海藻酸钠和明胶溶解于水中，制得壁材溶液；壁材溶液中，膳食纤维的质量浓度为3％～6％，海藻酸钠的质量浓度为1.5％～2％，明胶的质量浓度为3.5％～4.5％。
S3.将步骤2得到的壁材溶液与菌乳液混合，壁材溶液与菌乳液的体积比为1:2～2:3，混合均匀，得到混合液；将该混合液以液滴的方式加入到质量百分含量为5％～7％的CaCO3溶液中，混合液与CaCO3溶液的体积比为1:1.5-1:3，搅拌均匀，直至形成微囊颗粒；
S4.将纤维素溶解于溶剂中，制成质量百分浓度为6～9％包膜液；
S5.将步骤3所制得的微囊颗粒，置于流化床中，调整流化床进风温度至45～50℃，抽取含纤维素的包膜液进行包膜，得到包膜益生菌。
流化床底喷包衣机，包括机筒、进风管和排风管；进风管接通与机筒底部，机筒底部呈锥状；进风管接有风机，进风经加热器加热后进入到机筒底部设置的旋流筛板；机筒内设有两个球状喷头，喷头接有供液管，该供液管接有储液罐，该储液罐用于存储包衣液料；喷头呈球状，喷头的球形表面上设有多个喷嘴；喷嘴包括嘴体和嘴帽；嘴体上设有凸口，凸口上设有锁片；嘴帽上设有与凸口对应的凹口，凹口内壁设有与锁片对应的锁槽。通过改进喷头的结构，使雾化喷嘴的喷洒范围覆盖到四周，喷洒更加均匀，同时可以根据喷洒的需要盖上或者取下喷嘴帽，配合进风量的调节，达到更加和均匀的包衣效果。
包衣机是一种可以对丸剂、糖果等进行有机薄膜包衣、水溶薄膜衣、缓释性包衣的一种、节能、安全、洁净的机电一体化设备。包衣机适用于制药、化工、食品等行业。粉粒物料受转盘离心力、摩擦力和环隙气体浮力的共同作用，与喷入适量的雾化了的浆液混合、粘合聚集完成起母、造粒、颗粒放大、滚圆、包衣等几种功能。
目前，流化床包衣机是将丸剂置于包衣室内，通过高速热风将丸剂置于半空高速回旋，同时喷洒包衣溶液，高速热风将包衣溶液雾化，雾化后的包衣剂与丸剂混合，使其达到包衣的目的。但是，大多数包衣机无法达到连续工作的目的，即每次包衣程序完成后要先暂停包衣机，取出包衣机内完成的丸剂，在放入没有包衣的丸剂、再启动包衣程序，很不方便，无法实现生产的连续性，降低了工作效率。